Библиотека музея насчитывает более 20 тысяч единиц хранения. Книги — более 12 тысяч единиц хранения. В фондах большое количество научно-популярных журналов и краеведческих периодических изданий.

Историческая литература

В разделе «Историческая литература» библиотеки собраны издания по археологии, этнографии, истории России. Скомплектовано большое собрание книг по нумизматике, геральдике, бонистике, истории российских наград и др.

Краеведческая литература

В разделе «Краеведческая литература» скомплектованы издания по истории, культуре, экономике, природе Белгородчины. Собрана литература о знаменитых земляках края.
В краеведческом фонде библиотеки имеются редкие дореволюционные издания о Белгородском крае. Среди них такие, как «Журналы заседаний уездных земских собраний» (1865-1916 гг.), историко-статистический очерк А.М. Дренякина «Белгород с уездом» и др.

Методическая литература

В библиотеке скомплектовано большое собрание методической литературы по музейной работе: научно-фондовой, выставочно-экспозиционной, научно-просветительной и др. А также издания по истории музейного дела, различные каталоги, определители.

Периодическая печать

В библиотеке скомплектовано более 1600 подшивок областных и районных газет разных лет. Газета «Белгородская правда» хранится с 1946 года. Библиотека располагает большим собранием исторических журналов: «Российская археология», «Этнографическое обозрение», «Отечественная история», «Военно-исторический журнал» и др.

Справочная литература

Библиотека располагает всеми изданиями универсальных энциклопедий, начиная с энциклопедии Брокгауза и Ефрона, а также различными словарями и справочниками.